Медицинские услуги клиники по общему правилу НДС не облагаются, но это не освобождает вас от обязанностей налогового агента и не отменяет налог по сопутствующим операциям. Если вы продаёте товары, оказываете услуги, не входящие в медицинскую деятельность, или арендуете помещения, НДС считать придётся. Разберём, что проверить в вашей клинике и в каком порядке действовать.
Когда медуслуги не облагаются НДС
Освобождение привязано к виду деятельности, а не к названию организации. Медицинские услуги, которые клиника оказывает по своей лицензии, налогом не облагаются. Косметология, массаж, диагностика, стоматология — всё это относится к медицинским услугам, если есть разрешительная документация и услуга входит в вашу деятельность.
Проблема начинается там, где клиника смешивает медицинское и немедицинское. Продажа косметики, БАДов, очков, сопутствующих товаров — это обычная реализация. Аренда кабинета другому врачу — тоже. По таким операциям НДС начисляется в общем порядке.
Проверьте, что в договорах и первичных документах формулировки совпадают с тем, что вы реально делаете. Если в счёте написано «косметологические услуги», а по факту продана косметика, при проверке это вскроется.
Ставка и расчёт налога
Общая ставка НДС — 22 % (п. 3 ст. 164 НК РФ). Она применяется к операциям, которые облагаются налогом: продаже товаров, немедицинским услугам, аренде.
Отдельно смотрите на расчётные ставки. При реализации предприятия в целом как имущественного комплекса применяется расчётная ставка 18,03 % — это правило действует для товаров и имущественных прав, отгруженных и переданных начиная с 01.01.2026 (ст. 158 НК РФ). Для обычной клиники такая ситуация редкая, но если вы продаёте бизнес целиком, порядок именно такой: в сводном счёте-фактуре по каждому виду имущества указывается ставка 18,03 % и сумма налога как доля налоговой базы. К сводному счёту-фактуре прилагается акт инвентаризации.
Если вы работаете с иностранными партнёрами, проверьте место реализации услуг по ст. 148 НК РФ. От этого зависит, возникает ли у вас обязанность налогового агента.
Обязанности налогового агента
Отдельная история — аренда и закупки у иностранных компаний и у органов власти. По ст. 161 НК РФ вы как налоговый агент обязаны исчислить расчётным методом и уплатить в бюджет НДС. Это не зависит от того, исполняете вы сами обязанности налогоплательщика или нет.
Практический пример: клиника арендует помещение у города. Арендную плату вы перечисляете за вычетом НДС, налог платите в бюджет и сдаёте декларацию. Если этого не сделать, налог взыщут с вас как с агента.
Второй момент — отметка «Без налога (НДС)». Её проставляют в договоре и первичном документе продавцы, освобождённые от НДС, и лица, которые налогоплательщиками не являются. Если такая отметка проставлена недостоверно, обязанность по исчислению и уплате налога возлагается на продавца товаров. То есть клиника, которая необоснованно написала «Без налога (НДС)» в счёте на облагаемый товар, заплатит налог сама.
Если вы утратили право на освобождение или перешли с патентной системы на общий режим, налог по соответствующим операциям исчисляете с периода перехода.
Сроки: декларация и платежи
Декларацию по НДС подают в электронной форме не позднее 25-го числа месяца, следующего за кварталом. Налог платят равными долями не позднее 28-го числа каждого из трёх следующих месяцев (ст. 174 НК РФ).
Разберём на примере. За IV квартал 2026 года декларацию нужно подать до 25 января 2027 года. Платежи — до 28 января, 28 февраля и 28 марта 2027 года, каждый по трети суммы.
Декларация только электронная. Бумажную не примут, а значит, нужна квалифицированная электронная подпись и оператор. Проверьте это заранее, до конца квартала.
Ошибки, которые дорого стоят
Первая ошибка — считать, что раз медуслуги освобождены, то и вся клиника «без НДС». Сопутствующие продажи, аренда, немедицинские услуги облагаются. Разделяйте выручку и ведите раздельный учёт.
Вторая — неправильные формулировки в договорах и счетах. Если вы ставите «Без налога (НДС)» там, где операция облагается, налог доначислят вам как продавцу.
Третья — забыть про роль налогового агента при аренде у города или закупке у иностранной компании. Здесь налог платится даже теми, кто сам НДС не платит.
Четвёртая — пропустить срок подачи декларации. Восстановить пропущенное почти невозможно: электронный формат и жёсткие даты не оставляют пространства для манёвра.
Последствия стандартные: доначисление налога, пени за каждый день просрочки и штраф по результатам проверки. При регулярных ошибках в счетах-фактурах вычеты у ваших покупателей могут снять, и это уже их претензии к вам.
Что сделать сейчас
Пройдитесь по выручке за последний квартал и разделите её на медицинскую и прочую. Проверьте, что по облагаемым операциям НДС начислен и счета-фактуры выставлены правильно.
Проверьте договоры аренды и закупок: есть ли иностранные контрагенты или государственное имущество. Если есть — убедитесь, что вы исполняете обязанности налогового агента и отражаете это в декларации.
Сверьте формулировки в договорах и первичных документах с фактическими операциями. Уберите отметку «Без налога (НДС)» оттуда, где она необоснованна.
Убедитесь, что у вас есть действующая электронная подпись и доступ к оператору для сдачи отчётности. До 25-го числа следующего месяца всё должно работать.
Частые вопросы
Облагаются ли НДС медицинские услуги клиники?
Нет, медицинские услуги, которые клиника оказывает в рамках своей деятельности, от НДС освобождены. Но это не распространяется на продажу товаров, аренду и немедицинские услуги.
Нужно ли платить НДС, если клиника арендует помещение у города?
Да, в этом случае вы выступаете налоговым агентом и обязаны исчислить и уплатить налог в бюджет по ст. 161 НК РФ. Это не зависит от того, платит ли клиника НДС по своим услугам.
Какая ставка НДС применяется к облагаемым операциям клиники?
Общая ставка — 22 % (п. 3 ст. 164 НК РФ). При продаже предприятия в целом как имущественного комплекса применяется расчётная ставка 18,03 % (ст. 158 НК РФ).
Когда сдавать декларацию и платить налог?
Декларацию подают в электронной форме до 25-го числа месяца, следующего за кварталом. Налог платят равными долями до 28-го числа каждого из трёх следующих месяцев (ст. 174 НК РФ).
Услуга по теме: НДС: книги покупок и продаж, разрывы, вычеты, раздельный учёт.